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学校前身是1947年海强高级医事技术学校和1948年创建海南大学医学院，两校于1951年合并为海南医学专门学校（1977-1979年试办本科教育），后更名为海南医学专科学校，1983年并入海南大学成为海南大学医学部。1993年经国家教育行政主管部门批准正式建立海南医学院，隶属海南省人民政府主管。2003年被教育部确定为联合培养硕士学位研究生单位，2013年获批硕士学位授权单位，2019年获批博士学位授权单位。
| 年度 | 学校名称 | 全国排名 | 省内排名 |
| 2020 | 海南医学院 | 350 | 暂无 |
| 2019 | 海南医学院 | 401 | 3 |
| 2018 | 海南医学院 | 424 | 3 |
| 2017 | 海南医学院 | 414 | 3 |
| 2016 | 海南医学院 | 441 | 3 |
| 2015 | 海南医学院 | 427 | 3 |
| 2014 | 海南医学院 | 432 | 3 |
| 2013 | 海南医学院 | 416 | 3 |
最好大学版
| 年份 | 学校名称 | 全国排名 | 所在地 |
| 2020 | 海南医学院 | 378 | 海南 |
| 2019 | 海南医学院 | 暂无 | 海南 |
| 2018 | 海南医学院 | 386 | 海南 |
| 2017 | 海南医学院 | 302 | 海南 |
2020年度海南医学院一流本科专业建设点名单（国家级+省级）：
1个专业入选国家级一流本科专业建设点：医学检验技术
1个专业入选省级一流本科专业建设点：医学影像学
2019年度海南医学院一流本科专业建设点名单（国家级）：
