学院设有机电工程系、管理系、服装与艺术系、计算机系、基础课部、省级劳动技能鉴定站及技能培训中心,开设了数控技术应用、模具设计、计算机信息管理、电脑艺术设计、服装艺术设计,动漫设计与制作、酒店管理、市场营销、电算化会计、办公自动化等20多个特色专业。
湖南九嶷职业技术学院是在原“九嶷山学院”的基础上发展壮大起来的。2005年3月经省人民政府批准,正式成立“湖南九嶷职业技术学院”,隶属湖南省教育厅管理,纳入普通高等院校序列,面向全国计划招生。
2010年5月经省人民政府批准,由民办转为公办,并与潇湘技师学院合并办学,实行两块牌子一套人马。两院资源整合后,融学历教育和技能培训为一体,全面推行“学历证”和“职业资格证”双证制度,是一所以工科类为主的高职院校。目前学院设有四系两部(机电工程系、汽车工程系、服装艺术系、管理工程系、公共课部和思政部)。