国家级一流本科专业建设点：中医学、中药学、中西医临床医学、康复治疗学
国家特色专业：中医学、中药学、针灸推拿学
国家重点学科（4个）：中医外科、中药学、中医内科、中医骨伤科学
国家重点（培育）学科（2个）：中医医史文献学、针灸推拿学
国家中医药管理局中医药重点学科（38个）：药用植物学、中医诊断学、中医各家学说、中医药工程学、中医肝胆病学、中医传染病学、中医肾病学、中医肿瘤病学、中医肛肠病学、中医骨伤科学、中西医结合临床、针灸学、推拿学、古汉语与医古文、内经学、中西医结合基础、中医基础理论、中医复杂科学、中医史学、中医文化学、中医文献学、中医痹病学、中医疮疡病学、中医护理学、中医急诊学、中医乳腺病学、中医养生学、中西医结合临床、中医全科医学、中西医结合临床、中医护理学、中医药信息学、中医“治未病”学、中医康复学、中医皮肤病学、中医血液病学、中医儿科学、中医神志病学
上海市“重中之重”学科（1个）：中药学
上海市重点学科（9个）：中医妇科学、中医诊断学、中医系统实验方剂学、中医医史文献、中药学、针灸推拿学、中医骨伤科学、中医外科学、中医内科学
上海高校一流学科（6个）：A类-中药学；B类-中医学、中西医结合、科学技术史；培育-护理学、药学
上海高校高峰高原学科（4个）：I类高峰-中药学、I类高峰-中医学、I类高峰-中西医结合、I类高原-科学技术史
上海市教育委员会重点学科（5个）：中药临床药理学、中药药剂学、中医诊断学、中医脾胃病学、中西医结合基础
ESI全球前1%学科（2个）：临床医学、药理学与毒理学
2020上海中医药大学招生录取情况
| 省市 | 科类 | 批次 | 专业名称 | 年制 | 录取分 |
| 上海 | 综合改革 | 春季招生 | 中西医临床医学 | 5 | 346 |
| 上海 | 综合改革 | 春季招生 | 康复作业治疗 | 4 | 336 |
| 上海 | 综合改革 | 春季招生 | 康复物理治疗 | 4 | 333 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 中医学（5+3一体化针灸推拿英语方向） | 8 | 549 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 中医学（5+3一体化） | 8 | 544 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 中医学（五年制） | 5 | 538 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 针灸推拿学 | 5 | 534 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 预防医学 | 5 | 525 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 中药学 | 4 | 524 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 听力与言语康复学 | 4 | 521 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 生物医学工程（中医信息与工程方向） | 4 | 521 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 食品卫生与营养学 | 4 | 519 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 智能医学工程 | 4 | 519 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 药学（中外合作办学） | 4 | 519 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 公共事业管理（卫生管理方向） | 4 | 511 |
| 上海 | 综合改革 | 本科 | 护理学 | 4 | 506 |
| 上海 | 综合改革 | 综合评价 | 中医学（5+3一体化针灸推拿英语方向） | 8 | 548 |
| 上海 | 综合改革 | 综合评价 | 中医学（5+3一体化） | 8 | 543 |
| 上海 | 综合改革 | 高职高专 | 护理（中外合作办学） | 3 | 254 |
上海中医药大学是教育部与上海市人民政府共建高校，上海市重点建设的高水平大学，国家首批世界一流学科建设高校，世界一流中医药大学建设联盟、长三角医学教育联盟创始成员，上海市高水平地方高校建设试点单位，首批世界卫生组织传统医学合作中心，国际标准化组织中医药标准技术委员会秘书处所在地；入选国家“111计划”、卓越医生（中医）教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家“特色重点学科项目”、国家级大学生创新创业训练计划、新工科研究与实践项目、教育部人才培养模式创新实验区、国家理科基础研究和教学人才培养基地、国家大学生文化素质教育基地、中国政府奖学金来华留学生接收院校、上海市首批深化创新创业教育改革示范高校。学校与上海市中医药研究院合署运行。
学校创办于1956年，是新中国成立后国家首批建立的中医药高等院校之一。学校位于浦东新区张江综合性国家科学中心，地处张江科学城核心板块，占地500余亩。在全国第四轮学科评估结果中，中医学、中西医结合、中药学三个一级学科排名全国第一，均取得A+的优秀成绩，是全国中医院校中唯一取得3个A+的高校。
