2020年度海南热带海洋学院一流本科专业建设点名单（国家级+省级）
1个专业入选国家级一流本科专业建设点：旅游管理专业
1个专业入选省级一流本科专业建设点：社会工作
2019年度海南热带海洋学院一流本科专业建设点名单（省级）
5个专业入选省级一流本科专业建设点：海洋技术、旅游管理、环境工程、生态学、食品科学与工程
国家级专业综合改革试点项目：旅游管理
| 省级特色专业（部分） | ||
| 专业名称 | 所在单位 | 时间 |
| 社会工作 | 人文社科学院 | 2013 |
| 电子信息科学与技术 | 电子信息工程学院 | 2012 |
| 旅游管理 | 旅游管理学院 | 2011 |
| 汉语言文学 | 人文社科学院 | 2010 |
| 历史学 | 人文社科学院 | 2007 |
省级重点学科：动物学、旅游管理、环境工程、民族学、海洋科学、海洋工程
学校的前身是广东省1954年创办的海南黎族苗族自治州师范学校和1958年创办的海南黎族苗族自治州师范专科学校。几经分合、调整、更名，于1993年由海南省通什师范专科学校和海南省通什教育学院合并组建为琼州大学（专科），2006年琼州大学升格为本科院校，更名为琼州学院，同年4月海南民族师范学校并入琼州学院。2009年学校主校区由五指山市搬迁至三亚市。2015年9月，更名为海南热带海洋学院。2018年12月，海南省海洋与渔业科学院转隶归属学校管理。
