教育部每4年公布一轮学科评估结果，最近一轮为第四轮，以下是北京协和医学院学科评估结果，其中比较好的学科是基础医学、药学，被评为A+。
1、北京协和医学院学科评估结果排名
学科评估按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行，由于第五轮评估结果还未公布，这也是目前最新的排名。
评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10023 | 北京协和医学院 | 1001 | 基础医学 | A+ |
| 2 | 10023 | 北京协和医学院 | 1007 | 药学 | A+ |
| 3 | 10023 | 北京协和医学院 | 1002 | 临床医学 | A |
| 4 | 10023 | 北京协和医学院 | 1011 | 护理学 | A- |
| 5 | 10023 | 北京协和医学院 | 1004 | 公共卫生与预防医学 | B |
| 6 | 10023 | 北京协和医学院 | 1008 | 中药学 | B- |
| 7 | 10023 | 北京协和医学院 | 1006 | 中西医结合 | C+ |
| 8 | 10023 | 北京协和医学院 | 1205 | 图书情报与档案管理 | C |
| 9 | 10023 | 北京协和医学院 | 1204 | 公共管理 | C- |
以下是教育部公布的北京协和医学院双一流学科名单，也是北京协和医学院非常不错的一些学科。
北京协和医学院：生物学、生物医学工程、临床医学、药学
北京协和医学院是国家卫生健康委员会直属、与中国医学科学院实行院校合一管理体制的全国重点大学，属于世界一流学科建设高校，入选卓越医生教育培养计划。
学校前身是美英基督教教会于1906年共同创办的协和医学堂。1912年，改称协和医学校。1917年，成立北京协和医学院。1919年，改名北京协和医科大学。1929年，更名私立北平协和医学院。1951年1月，学校由中央人民政府教育部和卫生部接管，且改名为中国协和医学院。历经传承与发展，学校先后更名为中国医科大学、中国首都医科大学和中国协和医科大学。2006年定名北京协和医学院。
