教育部每4年公布一轮学科评估结果，最近一轮为第四轮，以下是新疆医科大学学科评估结果，其中比较好的学科是药学，被评为B-。
1、新疆医科大学学科评估结果排名
学科评估按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行，由于第五轮评估结果还未公布，这也是目前最新的排名。
评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10760 | 新疆医科大学 | 1007 | 药学 | B- |
| 2 | 10760 | 新疆医科大学 | 1002 | 临床医学 | C+ |
| 3 | 10760 | 新疆医科大学 | 1004 | 公共卫生与预防医学 | C |
| 4 | 10760 | 新疆医科大学 | 1006 | 中西医结合 | C |
| 5 | 10760 | 新疆医科大学 | 1001 | 基础医学 | C- |
| 6 | 10760 | 新疆医科大学 | 1011 | 护理学 | C- |
新疆医科大学，坐落于新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市，是一所省属重点大学，入选“卓越医生教育培养计划”、“中国政府奖学金来华留学生接收院校”，是中华人民共和国国家卫生健康委员会、教育部和新疆自治区共建高校。 2011年教育部确定中南大学、吉林大学、北京中医药大学为该校全面对口支援高校，同时还与复旦大学、中山大学、中国药科大学等20余所大学建立了长期援疆共建合作关系。
其前身新疆医学院始建于1954年，1956年建成招生。1998年6月，新疆医学院与新疆中医学院合并成立新疆医科大学。2011年11月4日，国家卫生部与新疆自治区签署了共建该校的协议。
