教育部每4年公布一轮学科评估结果，最近一轮为第四轮，以下是南京医科大学学科评估结果，其中比较好的学科是公共卫生与预防医学，被评为A+。
1、南京医科大学学科评估结果排名
学科评估按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行，由于第五轮评估结果还未公布，这也是目前最新的排名。
评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 10312 | 南京医科大学 | 1004 | 公共卫生与预防医学 | A+ |
| 2 | 10312 | 南京医科大学 | 1001 | 基础医学 | B+ |
| 3 | 10312 | 南京医科大学 | 1002 | 临床医学 | B+ |
| 4 | 10312 | 南京医科大学 | 1003 | 口腔医学 | B+ |
| 5 | 10312 | 南京医科大学 | 1011 | 护理学 | B+ |
| 6 | 10312 | 南京医科大学 | 1007 | 药学 | B |
南京医科大学（Nanjing Medical University）是首批教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省共建高校和江苏高水平大学建设高校，是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、江苏省高层次人才培养计划“333工程”培训基地，长三角医学教育联盟创始成员。
学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。2015年9月，获准成为首批教育部、国家卫生计生委与省政府共建医学院校。
