教育部每4年公布一轮学科评估结果，最近一轮为第四轮，以下是南方医科大学学科评估结果，其中比较好的学科是基础医学、公共卫生与预防医学、中西医结合，被评为B+。
1、南方医科大学学科评估结果排名
学科评估按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行，由于第五轮评估结果还未公布，这也是目前最新的排名。
评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 12121 | 南方医科大学 | 1001 | 基础医学 | B+ |
| 2 | 12121 | 南方医科大学 | 1004 | 公共卫生与预防医学 | B+ |
| 3 | 12121 | 南方医科大学 | 1006 | 中西医结合 | B+ |
| 4 | 12121 | 南方医科大学 | 0831 | 生物医学工程 | B |
| 5 | 12121 | 南方医科大学 | 1002 | 临床医学 | B |
| 6 | 12121 | 南方医科大学 | 1007 | 药学 | B |
| 7 | 12121 | 南方医科大学 | 1011 | 护理学 | B |
| 8 | 12121 | 南方医科大学 | 1003 | 口腔医学 | C- |
| 9 | 12121 | 南方医科大学 | 1008 | 中药学 | C- |
南方医科大学（Southern Medical University）前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年确定为全国重点大学，2004年8月整体移交广东省，更名南方医科大学。
广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，全国首批、广东唯一一所教育部、国家卫生健康委员会与广东省共建高校，首批开设八年制本硕博连读临床医学专业的8所高校之一，首批卓越医生教育培养计划试点高校，唯一开设八年制医学教育的独立医科院校，中国政府奖学金来华留学生接收院校，入选国家国家建设高水平大学公派研究生项目、广东省“211工程”、国家创新人才培养示范基地、国家国际科技合作基地，CDIO工程教育联盟成员。
