一、曲阜师范大学科研平台
根据2021年7月学校官网信息显示，学校建有省部级协同创新中心5个，9个省级重点实验室，2个省级工程技术研究中心，2个山东省“十三五”高校人文社科研究基地，1个省级重点智库，教育部、国家体育总局、山东省政府在学校设有8个省部级研究基地，获批成立山东省生命与安全教育研究中心。
山东省级重点实验室：山东省激光偏光与信息技术实验室、山东省生命有机分析实验室、山东省南四湖湿地生态与环境保护实验室（强化）、山东省智能控制技术实验室（强化）、山东省信息功能材料与光电技术实验室、山东省绿色天然产物及医药中间体开发实验室、山东省体适能监测与调控实验室
山东省级高等学校协同创新中心：孔子与山东文化强省战略协同创新中心、信息与能源量子功能材料协同创新中心
山东省级工程技术中心：激光偏光工程技术研究中心
日照市工程技术研究中心：日照市信息工程技术研究中心、日照市印刷工程技术研究中心、依日照市电气自动化工程技术研究中心
国家体育总局人文社会科学研究基地：国家体育总局体育社会科学重点研究基地
山东省级强化人文社会科学研究基地：孔子与传统文化研究中心、外国语言文化语翻译研究中心
山东省人文社会科学研究基地：山东省体育人文科学研究基地、山东省马克思主义中国化研究基地、山东省儒学研究基地、山东省中西语言文化交流研究基地
山东省重点新型智库建设试点单位：中国教育大数据研究院
山东省高校优秀科研创新团队建设计划：系统建模优化与控制科研创新团队、湿地生态保护与资源利用创新团队
共建智库：港澳教育研究中心（与教育部基础教育课程教材发展中心联合成立）、中国教育大数据研究院（与国家统计局中国统计信息服务中心共建）
共建协同创新中心：山东教育大数据协同创新中心（与山东省教育信息中心签约共建）
二、曲阜师范大学科研成果
根据2021年7月学校官网信息显示，建校初期的“公社数学”曾受到毛主席的赞扬，离子交换法制备碳酸钾获1978年全国科学大会奖，高性能晶体偏光器件获2002年国家科技进步二等奖。先后承担了国家“973”计划、“863”计划、国家重点研发计划项目在内的一大批高层次科研项目，在应用数学、激光偏光、电气信息、生物资源开发与利用、土地规划、物理化学、孔子儒学、教育科学、体育科学等学科领域达到了较高水平。
“十三五”以来，学校累计承担省部级以上纵向科研项目969项，科研经费近2亿元，其中国家社科基金项目140项，包括重大招标项目2项、重大招标滚动资助1项、重点项目9项；国家自然科学基金项目205项，山东省重大科技项目4项，参与国家重点研发计划项目等4项。获省部级科研成果奖145项。特别在人文社会科学研究方面具有独特优势，2020年以第一单位获得第八届教育部人文社科优秀成果奖一等奖1项、二等奖3项，居省属高校第1位，打破了山东省属高校12年来一等奖空缺的局面；近五年国家社科基金课题和教育部人文社科项目立项总数居省属高校前3位，连续10年获得山东省社会科学优秀成果奖一等奖。自然科学方面，2019年，获山东省属高校唯一1项国家自然科学奖二等奖；2019、2020连续两年获省自然科学奖数量居省属高校第1位，自然指数排名全国83位
国家自然科学二等奖：不确定性系统的辨识与控制（2015年，合作）、时延系统的鲁棒控制理论与方法（2019年，合作）
