首先，这一点希望大家清楚，教育部门并没有划分南京医科大学是一本还是二本，毕业证上只有本科和专科之分，是几本只是民间的说法。（某大学在某省是第一批次招生的话，就说该大学是一本大学，在第二批次招生的话，就说该大学是二本大学）
根据公开信息可知：南京医科大学在江苏和全国基本上是第一批次招生，所以我们通常认为南京医科大学是一本大学。（注：自2021年开始，江苏本科一批、二批合并为本科批）
根据全国985和211大学名单可知，南京医科大学不是211大学也不是985大学。以下是江苏985大学和211大学名单：
1、江苏2所985大学名单
| 序号 | 学校名称 | 学校类型 |
| 1 | 南京大学 | 综合 |
| 2 | 东南大学 | 综合 |
2、江苏11所211大学名单
| 序号 | 学校名称 | 学校类型 |
| 1 | 南京大学 | 综合 |
| 2 | 东南大学 | 综合 |
| 3 | 苏州大学 | 综合 |
| 4 | 江南大学 | 综合 |
| 5 | 河海大学 | 理工 |
| 6 | 中国矿业大学 | 理工 |
| 7 | 南京理工大学 | 理工 |
| 8 | 南京师范大学 | 师范 |
| 9 | 南京航空航天大学 | 理工 |
| 10 | 南京农业大学 | 农林 |
| 11 | 中国药科大学 | 医药 |
南京医科大学（Nanjing Medical University）是首批教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省共建高校和江苏高水平大学建设高校，是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、江苏省高层次人才培养计划“333工程”培训基地，长三角医学教育联盟创始成员。
学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。2015年9月，获准成为首批教育部、国家卫生计生委与省政府共建医学院校。
