医学科学与工程学院是北航服务“健康中国”战略的重要依托，定位国际一流，面向国际前沿、面向行业需求，以医工融合开展生物医学前沿探索、医疗技术与医疗装备创新，着重培养新工科与新医科交叉融合“厚通识、宽视野、多交叉”的“医工 ”复合型工程医学领军人才。学院依托“生物医学工程”全国A类学科和基础医学、特种医学学科，拥有包括北京高精尖创新中心在内的十余个省部级以上创新平台。
打造了以国际学术组织院士和会士、国务院学科评议组和教指委委员、国家高层次人才及生物医学工程学会理事长、教育部长江学者、杰青、优青、海外高层次人才等为代表的一流师资队伍，现有专任教师57人，70%以上具有高级职称，100%具有博士学位，90%以上具有海外经历。
面向现代医学在高新技术快速发展下的变化和需求，开展前沿创新、基础及应用研究，承担包括国家重点研发计划“ECMO系统研发”项目、国家重大科研仪器研制项目等在内的多项国家级重大、重点项目。研究成果获教育部自然科学一等奖2项、全国高校十大科技进展等，完成多项产业转化。
窦店实验室
智能医学工程专业聚焦智能诊疗、智慧健康、中医药工程等领域，融合人工智能、虚拟现实、大数据、机器人、新传感、新材料等工程前沿科技与生物信息学、现代分子细胞生物学及现代遗传免疫等生物医学新技术，实行医、工双导师制，本博柔性贯通，构建“医、理、工”交叉融合、“产教、科教”融通、接轨国际的创新人才培养体系，培养具有全球视野和国家使命感的工程医学“两领”人才。
毕业生就业升学前景广阔，毕业后既可以在大型医疗机构从事智能诊疗（精准医疗、智能手术、远程医疗、智能康复、健康信息系统等）相关工作；也可以在国内外一流大学、科研院所、高端医疗装备相关企业从事智能医学仪器及装备的研发、智能医学系统创新等工作；还可以在卫健委、药监局、疾控中心、海关等部门及事业单位从事相关管理工作。
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