南京中医药大学有药学院、护理学院、卫生经济管理学院、人工智能与信息技术学院、养老服务与管理学院、国际教育学院、继续教育学院、公共外语教学部、体育部、国际经方学院等学院，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、院系设置
中医学院·中西医结合学院
药学院
医学院·整合医学学院
针灸推拿学院·养生康复学院
护理学院
卫生经济管理学院
人工智能与信息技术学院
养老服务与管理学院
国际教育学院
继续教育学院
马克思主义学院·医学人文学院
公共外语教学部
体育部
国际经方学院
临床医学院：第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院
2、南京中医药大学简介
南京中医药大学创建于1954年，是全国建校最早的高等中医药院校之一，是江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校,学校于2017年入围国家“双一流”建设高校和江苏高水平大学建设高校，2018年成为教育部和江苏省共建“双一流”建设高校。建校之初，学校即为新中国高等中医药教育培养输送了第一批师资，编撰、制订了第一套教材和教学大纲，为新中国高等中医药教育模式的确立和推广作出了开创性贡献，被誉为中国“高等中医教育的摇篮”。
学校坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的古都南京。形成了以中医药为主体、中西医结合、多学科支撑协调发展的办学格局。
