南京审计大学有政府审计学院、社会审计学院、工程审计学院、会计学院、公共管理学院、经济学院、金融学院、法学院、监察学院、统计与数据科学学院等学院，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、院系设置
政府审计学院
内部审计学院（中内协内部审计学院）
社会审计学院
工程审计学院
会计学院
商学院（MBA教育中心合署）
公共管理学院
经济学院
金融学院
法学院
监察学院
统计与数据科学学院
计算机学院（智能审计学院）
数学学院（公共数学教学部）
文学院
外国语学院（大学外语教学部合署）
马克思主义学院
国际学院（国际文化交流学院、国际联合审计学院）
心理健康教育教学部
体育与艺术教学部
国际文化交流学院
国际联合审计学院
国富中审学院
2、南京审计大学简介
南京审计大学（Nanjing Audit University），简称南审。学校与国家审计署同时诞生，与中国审计事业同步发展，是中国审计高等教育发源地之一。2011年学校变更为三部一省共建高校（审计署、教育部、财政部和江苏省）。是一所以审计为品牌，经、管、法、工、文、理等学科相互支撑、协同发展的财经类院校。
南京审计大学起源于1983年的南京财贸学院。1987年更为南京审计学院，由审计署和南京市人民政府联办。1991年转制为审计署直属。2000年办学体制调整为江苏省人民政府与审计署合作共建，以江苏省人民政府管理为主。2002年南京金融高等专科学校并入，组建新的南京审计学院。2015年11月更名为南京审计大学。2017年，学校成为江苏省省级博士立项建设单位。
