| 学院 | 专业 | 报到校区 | 校区备注 |
| 农学院 | 农学 | 金山校区 | |
| 农学院 | 植物科学与技术 | 金山校区 | |
| 农学院 | 种子科学与工程 | 金山校区 | |
| 植物保护学院 | 植物保护 | 金山校区 | |
| 植物保护学院 | 制药工程 | 金山校区 | |
| 园艺学院 | 园艺 | 金山校区 | |
| 园艺学院 | 智慧农业 | 金山校区 | |
| 林学院 | 林学类 | 金山校区 | 含林学、森林保护、水土保持与荒漠化防治专业 |
| 林学院 | 智慧林业 | 金山校区 | |
| 林学院 | 自然地理与资源环境 | 金山校区 | |
| 生命科学学院 | 生态学 | 金山校区 | |
| 生命科学学院 | 生物工程 | 金山校区 | |
| 生命科学学院 | 生物科学类 | 金山校区 | 含生物科学、生物技术专业 |
| 生命科学学院 | 生物信息学 | 金山校区 | |
| 动物科学学院（蜂学学院） | 动物科学 | 金山校区 | |
| 动物科学学院（蜂学学院） | 动物医学 | 金山校区 | |
| 动物科学学院（蜂学学院） | 蜂学 | 金山校区 | |
| 海洋学院 | 海洋科学 | 金山校区 | |
| 海洋学院 | 水产养殖学 | 金山校区 | |
| 资源与环境学院 | 环境工程 | 金山校区 | |
| 资源与环境学院 | 空间信息与数字技术 | 金山校区 | |
| 资源与环境学院 | 农业资源与环境 | 金山校区 | |
| 食品科学学院 | 食品科学与工程 | 金山校区 | |
| 食品科学学院 | 食品营养与健康 | 金山校区 | |
| 食品科学学院 | 食品质量与安全 | 金山校区 | |
| 材料工程学院 | 材料科学与工程 | 旗山校区 | |
| 材料工程学院 | 化学工程与工艺 | 旗山校区 | |
| 材料工程学院 | 木材科学与工程 | 旗山校区 | |
| 材料工程学院 | 轻化工程 | 旗山校区 | |
| 材料工程学院 | 新能源科学与工程 | 旗山校区 | |
| 计算机与信息学院 | 电子信息工程 | 金山校区 | |
| 计算机与信息学院 | 计算机科学与技术 | 金山校区 | |
| 计算机与信息学院 | 软件工程 | 金山校区 | |
| 计算机与信息学院 | 统计学 | 金山校区 | |
| 计算机与信息学院 | 网络空间安全 | 金山校区 | |
| 计算机与信息学院 | 少数民族预科班 | 金山校区 | 预科培养地点为福建农林大学，具体就读地点以录取通知书为准 |
| 机电工程学院 | 车辆工程 | 旗山校区 | |
| 机电工程学院 | 电气工程及其自动化 | 旗山校区 | |
| 机电工程学院 | 机械设计制造及其自动化 | 旗山校区 | |
| 机电工程学院 | 农业智能装备工程 | 旗山校区 | |
| 交通与土木工程学院 | 工程管理 | 旗山校区 | |
| 交通与土木工程学院 | 交通工程 | 旗山校区 | |
| 交通与土木工程学院 | 森林工程 | 旗山校区 | |
| 交通与土木工程学院 | 土木工程 | 旗山校区 | |
| 交通与土木工程学院 | 物流工程 | 旗山校区 | |
| 交通与土木工程学院 | 智能建造 | 旗山校区 | |
| 风景园林与艺术学院 | 产品设计 | 旗山校区 | |
| 风景园林与艺术学院 | 城乡规划 | 旗山校区 | |
| 风景园林与艺术学院 | 动画 | 旗山校区 | |
| 风景园林与艺术学院 | 风景园林 | 旗山校区 | |
| 风景园林与艺术学院 | 环境设计 | 旗山校区 | |
| 风景园林与艺术学院 | 园林 | 旗山校区 | |
| 经济与管理学院 | 工商管理类 | 金山校区 | 含工商管理、文化产业管理、旅游管理专业 |
| 经济与管理学院 | 国际经济与贸易 | 金山校区 | |
| 经济与管理学院 | 会计学 | 金山校区 | |
| 经济与管理学院 | 金融学 | 金山校区 | |
| 经济与管理学院 | 农林经济管理 | 金山校区 | |
| 经济与管理学院 | 人力资源管理 | 金山校区 | |
| 公共管理与法学院 | 法学 | 金山校区 | |
| 公共管理与法学院 | 公共管理类 | 金山校区 | 含公共事业管理、行政管理、劳动与社会保障专业 |
| 公共管理与法学院 | 土地资源管理 | 金山校区 | |
| 乡村振兴学院 | 农村区域发展 | 金山校区 | |
| 戴尔豪西大学联合学院（国际学院） | 风景园林(中外合作办学) | 旗山校区 | |
| 戴尔豪西大学联合学院（国际学院） | 农业资源与环境(中外合作办学) | 旗山校区 | |
| 戴尔豪西大学联合学院（国际学院） | 生态学(中外合作办学) | 旗山校区 | |
| 戴尔豪西大学联合学院（国际学院） | 英语 | 旗山校区 | |
| 戴尔豪西大学联合学院（国际学院） | 园艺(中外合作办学) | 旗山校区 | |
| 未来技术学院 | 人工智能 | 金山校区 | |
| 未来技术学院 | 生物育种科学 | 金山校区 | |
| 未来技术学院 | 生物制药 | 金山校区 | |
| 未来技术学院 | 数据科学与大数据技术 | 金山校区 | |
| 安溪茶学院（数字经济学院） | 财务管理 | 安溪校区 | 前三年在安溪校区，第四年在金山校区 |
| 安溪茶学院（数字经济学院） | 茶学 | 安溪校区 | 前三年在安溪校区，第四年在金山校区 |
| 安溪茶学院（数字经济学院） | 电子科学与技术 | 安溪校区 | 前三年在安溪校区，第四年在旗山校区。 |
| 安溪茶学院（数字经济学院） | 商务经济学 | 安溪校区 | 前三年在安溪校区，第四年在金山校区 |
| 安溪茶学院（数字经济学院） | 数字经济 | 安溪校区 | 前三年在安溪校区，第四年在金山校区 |
| 安溪茶学院（数字经济学院） | 网络工程 | 安溪校区 | 前三年在安溪校区，第四年在金山校区 |
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