首先，这一点希望大家清楚，教育部门并没有划分南京农业大学是一本还是二本，毕业证上只有本科和专科之分，是几本只是民间的说法。（某大学在某省是第一批次招生的话，就说该大学是一本大学，在第二批次招生的话，就说该大学是二本大学）
根据公开信息可知：南京农业大学是双一流大学，在全国基本上也是第一批次招生，所以我们通常认为南京农业大学是一本大学。（注：自2021年开始，江苏本科一批、二批合并为本科批）
根据全国985和211大学名单可知，南京农业大学是211大学但不是985大学。以下是江苏985大学和211大学名单：
1、江苏2所985大学名单
| 序号 | 学校名称 | 学校类型 |
| 1 | 南京大学 | 综合 |
| 2 | 东南大学 | 综合 |
2、江苏11所211大学名单
| 序号 | 学校名称 | 学校类型 |
| 1 | 南京大学 | 综合 |
| 2 | 东南大学 | 综合 |
| 3 | 苏州大学 | 综合 |
| 4 | 江南大学 | 综合 |
| 5 | 河海大学 | 理工 |
| 6 | 中国矿业大学 | 理工 |
| 7 | 南京理工大学 | 理工 |
| 8 | 南京师范大学 | 师范 |
| 9 | 南京航空航天大学 | 理工 |
| 10 | 南京农业大学 | 农林 |
| 11 | 中国药科大学 | 医药 |
三、南京农业大学简介
南京农业大学（Nanjing Agricultural University）坐落于江苏省南京市，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学；位列世界一流学科建设高校、211工程、985工程优势学科创新平台，入选高等学校创新能力提升计划、高等学校学科创新引智计划、卓越农林人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部教育援外基地、国家大学生文化素质教育基地、国家理科基础科学研究和教学人才培养基地，是“双一流”农科联盟、高水平行业特色大学优质资源共享联盟、CDIO工程教育联盟成员单位。
学校前身可溯源至1902年三江师范学堂农业博物科和1914年金陵大学农科。1952年全国高校院系调整时，原国立中央大学金陵大学以及浙江大学的农学相关院系合并成立南京农学院。1984年更名为南京农业大学，2000年整建制划转教育部管理。
