首先，这一点希望大家清楚，教育部门并没有划分北京协和医学院是一本还是二本，毕业证上只有本科和专科之分，是几本只是民间的说法。（某大学在某省是第一批次招生的话，就说该大学是一本大学，在第二批次招生的话，就说该大学是二本大学）
根据公开信息可知：北京协和医学院是双一流大学，在全国基本上也是第一批次招生，所以我们通常认为北京协和医学院是一本大学。（注：自2019年开始，北京本科一批、二批合并为本科批）
根据全国985和211大学名单可知，北京协和医学院不是211大学也不是985大学。以下是北京所有985大学和211大学名单：
| 序号 | 学校名称 |
| 1 | 北京大学 |
| 2 | 清华大学 |
| 3 | 中国人民大学 |
| 4 | 北京师范大学 |
| 5 | 北京航空航天大学 |
| 6 | 北京理工大学 |
| 7 | 北京科技大学 |
| 8 | 北京邮电大学 |
| 9 | 中央财经大学 |
| 10 | 中央民族大学 |
| 11 | 中国农业大学 |
| 12 | 北京林业大学 |
| 13 | 中国传媒大学 |
| 14 | 北京工业大学 |
| 15 | 北京交通大学 |
| 16 | 中央音乐学院 |
| 17 | 对外经济贸易大学 |
| 18 | 北京中医药大学 |
| 19 | 北京外国语大学 |
| 20 | 中国地质大学（北京） |
| 21 | 中国政法大学 |
| 22 | 北京化工大学 |
| 23 | 华北电力大学 |
| 24 | 北京体育大学 |
| 25 | 中国矿业大学（北京） |
| 26 | 中国石油大学（北京） |
2、北京8所985大学名单
| 序号 | 学校名称 |
| 1 | 清华大学 |
| 2 | 北京大学 |
| 3 | 北京师范大学 |
| 4 | 中国人民大学 |
| 5 | 北京理工大学 |
| 6 | 中国农业大学 |
| 7 | 北京航空航天大学 |
| 8 | 中央民族大学 |
北京协和医学院（Peking Union Medical College）是中华人民共和国国家卫生健康委员会直属的唯一一所医科全国重点大学，与中国医学科学院实行院校一体的管理体制，是中国国家级医学科学学术中心和综合性科学研究机构。是国家首批世界一流学科建设高校、国家首批卓越医生教育培养计划项目试点高校。北京协和医学院由美国洛克菲勒基金会于1917年捐资创办，1919年10月开办八年制医学本科，是我国最早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的医学院校，国务院学位委员会自行审核博士学位授权一级学科点和硕士学位授权一级学科点的委托学位授予单位，国际医学科学研究组织正式成员单位，被誉为“中国医学殿堂”。
中国医学科学院1956年成立。北京协和医学院1917年成立。中国医学科学院和北京协和医学院自1957年起实行院校合一的管理体制。作为我国最高医学研究机构和最高医学教育机构，院校自成立以来始终以引领我国医学科技教育发展和维护人民健康为己任，为我国医学卫生健康事业的发展做出了重要贡献。
