安徽中医药大学有研究生院、中医学院、针灸推拿学院（康复医学院）、中西医结合学院（生命科学学院）、药学院、医药信息工程学院（网络信息中心）、医药经济管理学院、护理学院、马克思主义学院、体育健康学院等学院，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
1、院系设置
研究生院
中医学院
针灸推拿学院（康复医学院）
中西医结合学院（生命科学学院）
药学院
医药信息工程学院（网络信息中心）
医药经济管理学院
护理学院
人文与国际教育交流学院（外事办、港澳台办）
马克思主义学院
体育健康学院
继续教育学院（成人教育学院）
创新创业学院
新安书院
第一临床医学院
第二临床医学院
第三临床医学院
2、安徽中医药大学简介
安徽中医药大学（Anhui University of Chinese Medicine）坐落于安徽省合肥市，入选中西部高校基础能力（二期）建设项目，是安徽省高等教育振兴计划“地方特色高水平大学建设”高校、安徽省高峰学科建设计划支持高校。
安徽中医药大学创建于1959年，其前身为1952年创立的安徽省中医进修班。1959年，安徽省政府正式批准成立安徽中医学院。1970年，安徽中医学院并入安徽医学院。1975年，国家教育部批准恢复安徽中医学院。2000年，安徽省医药学校并入安徽中医学院。2011年，省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。2013年，教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。
